Le Centre de Compétence en Ecologie chimique (C₃E) a été créé comme successeur du Pôle de Recherche National Plant Survival (2001-2013), dans lequel la recherche en écologie chimique jouait un rôle dominant. L'écologie chimique est un domaine hautement interdisciplinaire qui touche aux interactions à médiation chimique qui existent entre les organismes. Cela concerne, entre autres, des chimistes qui identifient et synthétisent des substances bioactives, des physiologistes qui étudient la biosynthèse et la perception de ces produits chimiques chez les plantes et les animaux, mais aussi des écologistes qui examinent les effets des interactions à médiation chimique au niveau des individus et des écosystèmes. L'écologie chimique concerne tous les organismes, des bactéries aux êtres humains, et a donc des répercussions pour toute la biologie. Avant tout, la recherche possède un grand potentiel pour des applications dans le contexte de la sécurité de la nourriture, de la gestion des écosystèmes ainsi que dans la santé humaine et animalière.

Actuellement C₃E regroupe dix laboratoires à la faculté des sciences de UniNE. Il est étroitement associé avec la plateforme neuchâteloise de chimie analytique (NPAC) qui a été crée simultanément et qui offre des services analytiques mondialement aux institutions de recherche et aux industries. Ensemble avec des partenaires aux autres universités suisses, nous aspirons à mener de la recherche internationalement reconnue et offrir un enseignement en écologie chimique au plus haut niveau possible.